ČEPS jako provozovatel přenosové soustavy ČR spolupracuje bilaterálně především se svými sousedními partnery – provozovateli přenosových soustav v Bavorsku a ve východním Německu, Polsku, Rakousku a na Slovensku, a rovněž v rámci regionu střední a východní Evropy v Maďarsku a Slovinsku.

Zástupci ČEPS aktivně působí i v pracovních skupinách a týmech řady organizací a uskupení: ENTSO-E, CEE TSO, EURELECTRIC, CIGRE, TSC - TSO Security Cooperation, GCC – Grid Control Cooperation.

Představitel ČEPS rovněž předsedá národnímu komitétu Světové energetické rady – WEC.